Evenepoel war 48 Sekunden schneller als der Zweitplatzierte, der Vorjahressieger Primoz Roglic. Dritter wurde der Franzose Remy Cavagna.
In der Gesamtwertung baute Evenepoel seinen Vorsprung auf 2:41 Minuten vor dem Slowenen Roglic aus.
Derweil häufen sich die Corona-Fälle. Zum Zeitfahren trat der Brite Ethan Hayter nicht mehr an, wie dessen Team Ineos mitgeteilt hatte. Auch der zweimalige Etappensieger Sam Bennett wurde am Dienstagmorgen positiv getestet, teilte das deutsche Team Bora-Hansgrohe per Twitter mit.
Seit dem Auftakt der Vuelta am 19. August schied bereits mehr als ein Dutzend Fahrer wegen positiver Corona-Befunde aus. Bei der Tour de France mussten im Juli 17 positiv getestete Profis das Rennen vorzeitig beenden.
dpa/est