Zweiter wurde der Spanier Pello Bilbao. Die Führung in der Gesamtwertung übernahm der Etappen-Dritte Brandon McNulty. Der US-Amerikaner liegt nun 23 Sekunden vor dem Slowenen Primoz Roglic.
Bester Belgier war am Donnerstag Quinten Hermans auf Platz neun.
Die sechstägige Baskenland-Rundfahrt endet am Samstag mit einer Bergankunft in Arrate.
dpa/est