Der Franzose holte sich am Samstag bei der Fahrt über die staubigen Schotterstraßen in der Toskana nach 184 Kilometern rund um Siena den Sieg.
Alaphilippe griff wenige hundert Meter vor dem Ziel an und gewann im Sprint mit zwei Sekunden Vorsprung auf den Dänen Jakob Fuglsang.
Dritter wurde Wout van Aert, der mit 27 Sekunden Rückstand ins Ziel kam. Auch 2018 hatte van Aert das Rennen auf dem dritten Platz beendet. Vorjahressieger Tiesj Benoot wurde Fünfter.
dpa/belga/mh/km