Die Entscheidung wurde am Donnerstag nur einen Tag vor der Eröffnung bei einer Pressekonferenz mitgeteilt.
Grund dafür ist ein humoristisches Stück, in dem sich Kobayashi vor Jahren über den Holocaust lustig gemacht haben soll.
Das gesamte aktuelle Programm der Eröffnung soll nun noch einmal genau überprüft werden, so die Organisatoren.
Zuvor war bereits der Komponist für die Eröffnungsfeier wegen Mobbings von behinderten Kindern in seiner Schulzeit zurückgetreten.
dpa/vk