Hans Vanaken hatte die Gäste in Führung gebracht (21.), Carlos Cuesta (25.), Paul Onuachu (67.) und Bryan Heinen (81.) drehten das Spiel für die Hausherren.
Bei Brügge musste Abakar Sylla eine Viertelstunde vor Schluss mit Gelb-Rot vom Platz. In der ersten Halbzeit hatte schon Genks Trainer Wouter Vrancken wegen Meckerns Rot gesehen.
Genk hat nun 49 Punkte und damit 15 Punkte mehr als Vorjahresmeister Club Brügge auf Tabellenplatz vier.
sporza/sp