Präsident Ibrahim Boubacar Keita habe das Rücktrittgesuch angenommen, teilte sein Büro mit. Eine neue Regierung werde "nach Beratungen mit allen politischen Kräften" ernannt.
Mit dem Rücktritt kam Maiga einer Vertrauensabstimmung im Parlament zuvor. Zuletzt war es angesichts zunehmender Gewalt im Land zu Massenprotesten gegen den Regierungschef gekommen.
Seit 2013 gibt es eine Friedensmission der Vereinten Nationen in Mali. Sie gilt als gefährlichster UN-Einsatz weltweit. Vor allem im Norden greifen radikale Islamisten die Blauhelmsoldaten immer wieder an, während es im Zentrum des Landes zu gewaltsamen ethnischen Konflikten kommt.
dpa/jp